每個人心中都有屬於自己的心之花，這種花種類和顏色沒有完全壹樣的(有壹集除外，彩和真由的心之花都是翠菊)。心之大樹與心之花有著緊密的聯系。
花咲蕾是壹個熱愛花卉、非常了解花卉知識的初二學生。在搬家的途中在車上睡著，夢到在心之大樹前月光天使與暗之美少女的戰鬥和兩只精靈。
不料放學後，夢裏的精靈出現在的她的面前，並希望蕾能夠成為傳說中的戰士“光之美少女”，保護心之大樹別被邪惡的黑手摧毀。然而這時候不明的敵人出現，並且奪取班上同學繪裏香的“心靈之花”，唯有變身成為光之美少女進行戰鬥才能脫離敵人的魔掌、救出自己的同學！
