Gamma星雲第58號行星“K隆星”的人,為了侵略藍星(K隆星人對地球的稱呼),派遣了5人先遣部隊到藍星進行調查。其中Keroro軍曹行蹤敗露,被藍星人日向冬樹和日向夏美發現並生擒,侵略用武器“Kero球”落入冬樹手中。其後,侵略軍的飛船緊急撤退,丟下了在藍星的先遣部隊。於是,Keroro軍曹開始了“隸屬”於日向家的生活,離散在其他地方的另外4位先遣部隊成員也逐一現身…